комбинированный анализ ограничения бисульфита

комбинированный бисульфит ограничение экспертиза (или КОБРА) представляет собой молекулярный метод биологии, который позволяет для чувствительных количественной оценки DNA уровней метилирования при определенном геномном locus на DNA конкатенации в небольшом образце геномного DNA 2А2. Этот метод представляет собой разновидность бисульфитного секвенирования и сочетает полимеразную цепную реакцию на основе превращения бисульфита с ограничением переваривания. Первоначально разработанный для надежной обработки небольших количеств генома DNA из микродиссектированных образцов ткани, DNA залитых парафином, этот метод с тех пор широко используется в исследованиях рака и исследованиях эпигенетики.

Изображение 137A | Первые несколько шагов COBRA и молекулярные изменения, вызываемые каждым шагом метилированных и неметилированных сайтов CpG. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) из Wikimedia Commons

судопроизводство

бисульфитная обработка

геномный DNA интерес обрабатывает бисульфит натрия, который вводит метилирование-зависимое различия конкатенации. Во время лечения бисульфитом натрия неметилированные остатки цитозина преобразуются в урацил, тогда как остатки метилированного цитозина остаются неизменными.

Изображение 137A | Первые несколько шагов COBRA и молекулярные изменения, вызываемые каждым шагом метилированных и неметилированных сайтов CpG. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) из Wikimedia Commons

Изображение 137A | Первые несколько шагов COBRA и молекулярные изменения, вызываемые каждым шагом метилированных и неметилированных сайтов CpG. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) из Wikimedia Commons

Автор : Milos Pawlowski

Ссылки:

Методы молекулярной биологии I

Техника молекулярной биологии II

Комментарии