использование плазмид в качестве метода молекулярной биологии поддерживается программным обеспечением биоинформатики. Эти программы регистрируют конкатенацию плазмидных векторов DNA, помогают предсказать сайты разрезов ограничивающих ферментов и спланировать манипуляции. Примерами пакетов программного обеспечения, которые обрабатывают карты плазмид, являются ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI и WebDSV. Эти части программного обеспечения помогают проводить полные эксперименты in silico перед проведением влажных экспериментов.
коллекции плазмид
многие плазмиды были созданы за эти годы, и исследователи предоставили плазмиды в базы данных плазмид, например, некоммерческим организациям Addgene и BCCM / LMBP. Можно идентифицировать и запрашивать плазмиды из этих баз данных для исследования. Более того, исследователи часто загружают плазмидные последовательности в базу данных NCBI, из которой могут быть извлечены последовательности конкретных плазмид.
Изображение 239A | Схематическое изображение вектора pBR322 с сайтами ограничения, указанными синим цветом. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Комментарии
Отправить комментарий