ChIP - это мощный инструмент для селективного обогащения последовательностей DNA, связанных с конкретным белком в живых клетках. В любом случае, широкое использование этой операции было ограничено отсутствием достаточно надежной операции, чтобы раскрыть все обогащенные последовательности DNA. Операция ChIP усиливает специфические сшитые комплексы ДНК-белок с помощью антитела против интересующего белка. Хорошее описание протокола влажной лаборатории ChIP см. В ChIP-on-chip. Затем к небольшим участкам DNA, которые были связаны с представляющим интерес белком, добавляются олигонуклеотидные адаптеры, чтобы обеспечить массовое параллельное секвенирование.
последовательность действий
после выбора размера все полученные фрагменты ChIP-ДНК одновременно секвенируются с использованием секвенатора генома. За один прогон секвенирования можно сканировать ассоциации по всему геному с высоким разрешением, что означает, что особенности могут быть четко расположены на хромосомах. ChIP-chip, напротив, требует больших наборов тайлинговых массивов для более низкого разрешения.
Изображение 129A | Обзор рабочего процесса сухой лабораторной части эксперимента ChIP-on-chip. | отмечен как общественное достояние | Page URL : (https://en.wikipedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_dry-lab.png) из Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Комментарии
Отправить комментарий