начиная с биологического вопроса, эксперимент ChIP-on-chip можно разделить на три основных этапа: Первый - это настройка и планирование эксперимента путем выбора соответствующей матрицы и типа зонда. Во-вторых, настоящий эксперимент проводится в мокрой лаборатории. Наконец, во время части цикла в сухой лаборатории собранные данные анализируются, чтобы либо ответить на первоначальный вопрос, либо привести к новым вопросам, чтобы цикл можно было начать заново.
часть рабочего процесса с влажной лабораторией
на первом этапе интересующий белок (POI) перекрестно связывается с сайтом DNA, с которым он связывается в среде in vitro. Обычно это достигается путем нежной фиксации формальдегидом, обратимой нагреванием.
затем клетки лизируют и DNA измельчают ультразвуком или с помощью микрококковой нуклеазы. Это приводит к получению двухцепочечных фрагментов DNA -фрагментов, обычно длиной 1 т.п.н. или меньше. Те, которые были поперечно связаны с POI, образуют POI-ДНК complex .
Изображение 127A | Обзор рабочего процесса эксперимента ChIP-on-chip. | Zirguezi / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_workflow_overview.svg) из Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Комментарии
Отправить комментарий