DRIP-seq естественно используется для картирования R-петель по всему геному. Идентификация сайтов формирования R-loop позволяет изучать различные клеточные события, как показано службой образования R-loop в определенных областях, характеристикой этих областей и влиянием на форму экспрессии гена. Таким же образом его можно использовать для изучения влияния R-петель на другие процессы, такие как репликация и синтез DNA. Косвенно DRIP-seq может выполняться на мутантных клеточных линиях, дефицитных по генам, участвующим в R-loop разрешающая способность. Эти типы исследований предоставляют информацию, относящуюся к роли мутировавшего гена в подавлении образования ДНК-РНК и потенциально имеющую отношение к значению R-петель в нестабильности генома.
DRIP-seq был впервые использован для полногеномного профилирования R-петель у людей, который показал широко распространенное образование R-loop на промоторах CpG-островков. В частности, исследователи обнаружили, что образование R-loop связано с неметилированным состоянием CpG-островков.
DRIP-seq позже был использован для профилирования образования R-loop в сайтах начала и терминации копирования в плюрипотентных клетках Ntera2 человека. В этом исследовании исследователи обнаружили, что R-петли на 3'-концах генов могут быть связаны с прекращением копирования.
Изображение 156A | R-loop и моноклональные антитела S9.6 | Kmnip / CC BY (https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:R_loop_S9.6_mAb.svg) из Wikimedia Commons
Автор : Yavor Mendel
Комментарии
Отправить комментарий